Комиссии экспертов могут создаваться как разной, так и одной специальности. В первом случае такие комиссии предназначены для проведения комплексной экспертизы - во-втором, как правило, для повторной экспертизы или для сложных первичных экспертиз. Комиссионный характер исследования определяется лицом, назначившим судебную экспертизу, с учетом методических рекомендаций, сформированных специально для суда (следователя). Обоснование необходимости комиссионной экспертизы приводится сторонами дела с учетом сложности исследования, возможными затруднениями одного эксперта, которые могут возникнуть при анализе объектов, выполненных в специфичных условиях, и где требуется практический опыт приминительно к таким условиям. Повторная экспертиза по ее функциональному назначению должна устранять возникшие неясности или противоречия по результатам первичных (или прежних повторных) экспертиз, а соответственно поручаться комиссии экспертов с длительным опытом практической деятельности, и способных разъяснить причины их происхождения.