Комиссии экспертов могут создаваться как разной, так и одной специальности. В первом случае такие комиссии предназначены для проведения комплексной экспертизы - во-втором, как правило, для повторной экспертизы или для сложных первичных экспертиз. Комиссионный характер исследования определяется лицом, назначившим судебную экспертизу, с учетом методических рекомендаций, сформированных специально для суда (следователя). Обоснование необходимости комиссионной экспертизы, как правило, приводится сторонами дела с учетом сложности исследования, возможными затруднениями одного эксперта, которые могут возникнуть при анализе объектов, выполненных в специфичных условиях, и где требуется практический опыт приминительно к таким условиям. Повторная экспертиза по ее функциональному назначению и смыслу должна поручаться комиссии экспертов с длительным опытом практической деятельности, способных ставить достоверность применения методических правил и стандартов исследования выше корпоративных интересов того или иного экспертного учреждения (организации).