Комиссионный характер исследования определяется лицом, назначившим экспертизу, с учетом методических рекомендаций, сформированных специально для суда (следователя). Обоснование необходимости комиссионной экспертизы приводится сторонами дела с учетом сложности анализа объектов или специфичных условий их выполнения. Повторная экспертиза по своему назначению должна подтвердить/опровергнуть выводы первичной или прежних повторных экспертиз, устранять возникшие неясности или противоречия в случае расхождения выводов. Такие исследования должны поручаться комиссии экспертов с длительным опытом практической деятельности, предпочтительно в иной организации (структуре), проводившей прежние экспертизы. Либо состав комиссии должен состоять из специалистов различных ведомств (экспертных образований). Стоимость комиссионных экспертиз определяется теми же критериями оценки исследования с учетом дополнительно решаемых вопросов и привлечения к нему других экспертов.