Участие эксперта (специалиста) в уголовном судопроизводстве регулируется нормами уголовно-процессуального кодекса Российской Федерации (статьи 57, 58, 62, 70, 71, 74, 80, 168, 195 - 207, 270, 282, 283 УПК РФ).

Производство экспертизы, которое может быть поручено как государственному, так и негосударственному эксперту (статья 195 УПК РФ), осуществляется на основании решения лица, производящего расследование либо по решению суда. Привлечение специалистов для участия в деле также осуществляется по решению следователя (статьи 58, 168 УПК РФ). Стороне защиты не может быть отказано в удовлетворении ходатайства о привлечении специалиста к участию в производстве по уголовному делу для разъяснения вопросов, входящих в его профессиональную компетенцию.

Вопросы перед экспертом/специалистом могут ставить как лицо, производящее расследование (суд), так и стороны. Субъектом принятия решений в уголовном судопроизводстве является лицо, производящее расследование, а также суд, рассматривающий дело.

Основные усилия защиты, как правило, сосредотачиваются на стадии судебного разбирательства, где, в том числе ненадлежащее качество заключений ведомственных экспертов может быть рассмотрено на соответствие методическим положениям.

Следует помнить, что качество судебной экспертизы не зависит от принадлежности эксперта к государственному либо к частному учреждению. Причиной тому является сохранение у первых устаревшего, не отвечающего требованиям судопроизводства организационно-структурного построения, у подавляющей части вторых - замена задач судебной экспертизы коммерческой эффективностью. Поэтому основным критерием выбора является не учреждение, а судебный эксперт, в первую очередь, его личностные, в том числе квалификационные характеристики, основанные на сведениях о его прошлой и текущей трудовой деятельности.